Уроженец и житель Ленинграда, протоиерей Е. М. Кондратьев окончил Санкт-Петербургскую духовную академию и семинарию, кандидат богословия. В 1892-1894 гг. служил в церкви Сергия Радонежского при Громовском детском приюте, в 1894-1909 гг. – в церкви Успения Пресвятой Богородицы (Спас на Сенной), 1900 года – секретарь общества вспоможения бедным при церкви Успения. Последнее место служения – Храм св. прав. Иова Многострадального на Волковском кладбище. В 1915-1917 гг. – редактор журнала «Воскресный благовест» и приложения к журналу «Известия по Санкт-Петебургской епархии»

церкви Волковского кладбища. Проживал по адресу: Расстанная ул., д. 25а, кв. 2. Арестован 22 февраля 1938. Особой тройкой УНКВД Ленинградской области 10 марта 1938 года приговорен по ст. 58-10 УК РСФСР к высшей мере наказания. Расстрелян в Ленинграде 12 марта 1938 года. Место захоронения неизвестно. Реабилитирован 25 октября 1957 года.